בנייה קלה ירוקה לדוגמא,

כדי לבנות מכלולים כיוונית, הורה, שבו יחידות בנייה יכולות להרכיב זאת עם נטייה מסוימת ובסדר ליניארי ספציפי, עבור בנייה קלה יש צורך בשתיים או יותר ספציפי מוטיבים אינטראקציה. יתר על כן, קבלני בנייה קלה אשר מוכרת גם כ בנייה מודולרת יכולים לגרום לפרויקט בנייה קלה להשתנות ובנוסף קבלני בנייה קלה ירוקה תמיד יכולים לשלוט על הגודל והקוטר המכלולים הליניארים, המרחק בין שני מוטיבים אינטראקציה צריך להיות מגוון. בעבודת בנייה הנוכחית יש לנו אפשרות בנייה כי בדקנו את ההשפעות על הזיקה המחייבת מולקולות פרויקטים של בנייה קלה שונים וגם סוג הפרויקט בנייה משתנה באורך, סליל טוויסט וגמישות של אזור מקשר שמפריד בין המוטיבים אינטראקציה בכל מודול. אנו מראים כי כמה מסוגי ה בנייה האלה יכולים לקשר בריכוזים תת-מיקרו, המצביע על כך במגוון רחב של יחידות בנייה והרכבה יכול לשמש עבור בניהה של ננו-רנ”א. יתר על כן, עבודה זו מראה כי שיטה זו של בנייה אשר נקראת בשלוש שמות בנייה ירוקה בנייה קלה וגם בנייה מודולרית אשר שיטת בנייה זו יכולה לשמש כפיגומים כדי לקבוע זיקות מחייבות של אינטראקציות בסוגי בנייה שונים.

בנייה קלה ירוקה מספרת על חומרים ושיטות

בנייה קלה עיצוב של פיגומים
הרצף של כל מולקולת הפרויקט בנייה קלה נבחר כדי למזער את התרחשותם של מבנים משניים חלופיים. רצפים נבדקו על ידי הגשתם לתכנית קיפול של בנייה קלה ירוקה הנקראת גם בנייה מודולרית (הגרסה 3.0, שמנבאת את המבנה המשני המועדף thermodynamically של סוגי בנייה אשר נתן רצף, להשוואה עם המבנה משני הרצוי. שלושה פיגומי RNA העיקריים שהוצגו במאמר זה עוצבו באופן ידני בשלושת ממדים באמצעות MANIP (21) ונופי 3D נוצרו עם DRAWNA (22). המודלים 3D של צורות dimeric של כל פיגומים, נאספו על ידי המניפולציה שני מוטיבים לולאת קולט זהים, שחולצו ממבנה תחום P4-P6 של הקבוצה ב בנייה קלה (URX053 NDB קובץ) (23) כדי לאפשר ההחדרה של סלילים-צורה של 10, 21 או 32 נקודות בסיס.